Do zestawów BioPress 6000/8000 i 10000/12000 Sercem filtra są gąbki filtracyjne - szczególnie ten zestaw gąbek filtracyjnych, który łączy niebieskie i czarne gąbki na niewielkiej przestrzeni. Czarne gąbki filtracyjne mają wyjątkowo dokładne właściwości filtracyjne, podczas gdy niebieskie mają właściwości filtracji zgrubnej. Oznacza to, że w zależności od natężenia przepływu wody, najmniejsze lub tylko większe cząsteczki są wychwytywane przez gąbki i w ten sposób usuwane z wody w stawie. Gąbki pełnią jednak nie tylko klasyczną funkcję filtracyjną, ale także zapewniają mnóstwo przestrzeni życiowej dla najmniejszych bakterii. Ta mała biologiczna oaza w gąbkach filtracyjnych zapewnia konwersję toksyn w stawie: w niebieskich gąbkach substancje toksyczne są przekształcane w nieszkodliwe, ale stymulujące glony substancje (nitryfikacja), które z kolei są przekształcane w naturalnie występujące gazy w czarnych gąbkach (denitryfikacja).